Заселение Островов Общества в рамках полинезийской экспансии происходило относительно поздно. В первой волне заселения были достигнуты острова Фиджи, Самоа, Тонга и в заключении Маркизские острова, откуда уже приблизительно в 400 году произошло заселение Островов Общества.

Европейским первооткрывателем острова считается Джеймс Кук, который наблюдая проход Венеры по солнечному диску, во время своего первого путешествия в 1769 году, проплывал между Островами Общества. Однако впервые высадился он на Бора-Бора лишь в 1777 году в ходе своего третьего путешествия. Другие источники, считают первооткрывателем британского офицера Самуеля Уоллиса, который во время своего кругосветного плавания в 1767 году посетил Острова Общества и открыл остров Таити

2 апреля 1786 года, французский мореплаватель Луи Антуан де Бугенвиль достиг острова Таити и объявил Острова Общества владением Франции, основав тем самым современную Французскую Полинезию. Этот шаг поначалу не имел никаких последствий, так как до середины XIX столетия, Бора-Бора и остальные Острова Общества продолжали оставаться в сфере влияния королевской династии Помаре (Таити).

Однако после того как королева Вахине IV поддавшись угрозам французского адмирала признала французскийпротекторат над её владениями, её сын и наследник престола Арияне, в 1880 году отказался от всяких притязаний натрон. Следствием данного поступка стала аннексия Островов Общества Францией и провозглашение их французскойколонией.

Во время второй мировой войны, Бора-Бора, после атаки японской морской авиации на Пёрл Харбор 7 декабря 1941 года, становится важной базой снабжения США в южной части Тихого океана. Американская армия содержала на острове нефтебазу, взлётно-посадочную полосу и базугидросамолётов. Многочисленные тактически важные области острова были защищены при помощи береговых батарей и зенитных установок, проржавевшие остовы которых можно обнаружить и сейчас. Тем не менее во время войны база ни разу не подверглась атаке и в 1946 году была расформирована.

Сегодня Бора-Бора является частью территорий во Французской Полинезии (фр. Territoire de la Polynesie Francaise) и управляется из Папеэте. В Вайтапе расположены лишь органы местного самоуправления. Денежной единицей Французской Полинезии является тихоокеанский франк, стоимость которого фиксирована по отношению к евро.

Флаг Французской Полинезии представляет собой прямоугольное полотнище с тремя горизонтальными полосами красного, белого и красного цветов. Ширина центральной белой полосы в два раза больше ширины красных полос. В центре белой полосы расположено изображение символа Французской Полинезии: полинезийское каноэ с красными парусами на фоне 10 солнечных лучей и 5 рядов морских волн синего и белого цветов.

На каноэ находятся стилизованные изображения пяти человечков коричневого цвета, которые символизируют пять архипелагов Французской Полинезии. Солнечные лучи символизируют жизнь. Океан символизирует богатство.

Современный флаг был принят 20 ноября 1984 года на основе флага Таити. А что бы отличить их от друг друга и была помещена центральная эмблема.

По своему статусу Французская Полинезия является заморским сообщество Франции, поэтому наряду с флагом Французской Полинезии на правительственных учреждениях и официальных мероприятиях вывешивается также флаг Франции